事件ファイルCASE FILE
標的（ターゲット）は毛利小五郎（デジタルリマスター）
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バー「レモン」で飲んでいた小五郎は酔っ払って千鳥足で帰途につく。その時、工事現場から数本の鉄パイプが落下してきて、小五郎は間一髪、何とか避けて軽傷で済む。事務所に戻った小五郎が蘭に手当してもらっていると、上着の携帯にメールが届く。メールには「次は失敗しない」と書かれていた。鉄パイプが落下してきたのは偶発的な事故ではなく、誰かが故意に小五郎の命を狙ってやった事だったのだ。小五郎は犯人に心当たりがなく、過去に捕まえた悪人から逆恨みされたと考える。
この後、蘭は小五郎の携帯が違う事に気付く。よく見ると上着も小五郎のものではなく、内側に木村と刺繍されていた。小五郎はバーで木村という人の上着を間違って着て帰ったのだ。小五郎は犯人が狙っているのは自分じゃないとわかって一安心する。翌日、小五郎はコナン、蘭とバーを訪ね、マスターの井上から話を聞く。木村は最近店に来るようになった客。昨夜、木村は小五郎が寝ている間に帰ったという。高木刑事は木村の携帯にメールを送った携帯のアドレスを調べ、盗難された携帯と判明する。
人違いから変な事件に巻き込まれた小五郎はバー「レモン」に行った理由を高木に説明。一週間前、小五郎は駅前で1周年記念の無料券をもらって、このバーに行くようになったという。佐藤刑事は聞き込みをして、昨夜、鉄パイプが落下した直後に現場から走り去る男がいたという証言を得る。その男は右肘に傷があったという。この後、コナン、蘭は他人事の小五郎を連れて聞き込みをして、木村の所在を探し回る。その時、小五郎に向かって車が突っ込んでくる。
小五郎は間一髪逃げたが、話を聞いていた人が跳ね飛ばされてしまう。走り去った車を運転していた男の右肘には傷があった。小五郎を襲った車は盗難車で、目暮警部は本気で命を狙う計画的犯行と判断する。その時、小五郎が持っている木村の携帯にメールが届く。それは次こそ命がないという内容だった。小五郎は自分の巻き添えになってケガ人が出た事から本腰を入れて犯人探しを始める。目暮たちは木村を見つけようとするが3日経っても有力な情報は掴めない。コナンは鉄パイプに指紋が残っていなかった事から犯人は既に指紋を登録されている逮捕歴のある人間と推理する。
犯人は木村を狙っているが、コナンは小五郎の性格をよく知る人物が犯人と推理し、過去に小五郎が解決した事件を調べる。この後、コナンがバー「レモン」を訪ねると、ちょうど井上が小五郎に電話をかけていた。木村の奥さんから連絡があったらしく、井上は木村が米花湖にいる事を小五郎に教える。奥さんによれば、今朝、妙な男性が木村の家の様子を伺っていたという。電話を切った小五郎は米花湖へと急ぎ、コナンはバーにある木村のボトルを見て事件の真相に気付く。犯人の標的は小五郎だった…。